В 1900 году капитан парохода "Арчер", проходя мимо Фланнанских островов, обнаружил, что исчез огонь маяка Эйлин Мор. Об этом он доложил Шотландской береговой охране. Но из-за шторма невозможно было выяснить причину произошедшего.
К тому моменту на маяке должны были дежурить Томас Маршалл, Джеймс Дукат и Дональд Макартур. Они все были опытными смотрителями, которые добросовестно выполняли свои обязанности. Охрана заподозрила, что произошла катастрофа. Однако главному смотрителю маяка Джозефу Муру удалось подобраться к объекту лишь спустя 11 дней после тревожного сигнала, 26 декабря.
Он наткнулся на плотно запертую дверь башни, на кухне стоял накрытый ужин. И только перевёрнутый стул нарушал обстановку. Словно из-за стола выбегали. При более детальном осмотре стало понятно, что исчезли некоторые инструменты, а в гардеробе не хватает курток. При изучении журнала оказалось, что в окрестностях островов бушевал шторм.
Так как сотрудники пропали, Мур сам нёс вахту около месяца. После этого он регулярно твердил о голосах, звавших его.
По официальной версии, поднялся шторм, двое сотрудников бросились укреплять ограждения, но стихия резко возросла до невиданных размеров, и их смыло в воду. На помощь поспешил третий, однако его постигла та же участь. Но легенды о неведомой силе до сих пор окутывают острова.